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== 晚年 ==
晚年出任總統府秘書長，除深受蔣經國重用，更是國民黨內保守派大將，然而在面對要求解除戒嚴、開放中央民代全面普選、開放大陸探親等議題全部持反對態度，與社會主流意見及蔣經國的態度日益脫節，挨批「冥頑不靈」、「死守過去」、「不知變通」。

1988年連戰出任外交部長，一上任即促成「蘇聯貿易訪問團」成行。訪蘇是南中國經貿外交的一大突破，但這項大膽的外交行動由於事先未按過去的常例徵詢沈昌煥的意見，在決策定案之後，又不理會沈的勸阻，引起沈昌煥的恐慌和不滿。於是，沈昌煥便在國民黨中常會中大舉反攻，手拿《蘇俄在中國》一書痛斥「訪蘇團」的成行，結果被李登輝順水推舟地解除其總統府秘書長的職務，轉任總統府資政，結束了外交上近30年的「'''沈昌煥時代'''」。

轉任資政後，多所賦閒，偶爾出席一些活動，1998年7月2日過世。